Als leermeester aan de Officers Academy moet je studenten aansturen in turn-based RPG-gevechten. Naarmate het verhaal zich ontvouwt, zal de keuze voor een van de huizen van de Officers Academy van grote invloed zijn op je positie wanneer in Fódlan een grote oorlog oplaait. Vijf jaar later staan voormalige vrienden uit de andere klassen oog in oog met elkaar als gezworen vijanden. De game bevat de verfijnde gameplay waar Fire Emblem bekend om staat. Je stuurt een groep krijgers aan om te bewegen en te vechten op een grid-based slagveld en voor de eerste keer in de serie kun je nu ook individuele eenheden in de strijd ondersteunen door bataljons troepen toe te wijzen.